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Une apoenzyme, également appelée apoprotéine, est une enzyme (donc une protéine) non accompagnée de son coenzyme ou de son cofacteur. La liaison de l’apoenzyme avec l’un ou l’autre aboutit à l’enzyme active, encore appelée holoenzyme.
Pour complexifier les choses, holoenzyme est aussi le nom donné à certains complexes enzymatiques qui ne sont actifs que si toutes les sous-unités qui le constituent sont présentes. C’est notamment le cas des ADN-polymérases.